Sabe em configuration.lua, a tabela onde você configura o moveset do pokémon? Lá, você tem que configurar o Deoxys com as spells que o transformam tendo o nome da transformação. Por exemplo:
move1 = {name = "Deoxys Attack", level = 100, cd = 5, dist = 1, target = 0, f = 0, t = "psychic"},
move2 = {name = "Deoxys Defense", level = 100, cd = 5, dist = 1, target = 0, f = 0, t = "psychic"},
move3 = {name = "Deoxys Speed", level = 100, cd = 5, dist = 1, target = 0, f = 0, t = "psychic"},
Certifique-se de ter colocado o código da spell no local adequado.
Não respondo PMs solicitando suporte. Já existem seções no fórum para isto.